U Odseku za internu reviziju obavljaju se sledeći poslovi:

• priprema predloga Povelje interne revizije;
• priprema i izrada nacrta strateškog i godišnjeg plana interne revizije;
• pregledanje i davanje saglasnosti na konačan revizorski izveštaj
• izveštavanje direktora Uprave kroz godišnji izveštaj o radu interne revizije, periodične izveštaje i izveštaje o svakoj izvršenoj internoj reviziji sa svim važnim nalozima i datim preporukama, kao i preduzetim radnjama za poboljšanje poslovanja; praćenje sprovođenja preporuka navedenih u izveštajima iz prethodno obavljenih revizija;
• saradnja sa Državnom revizorskom institucijom, drugim državnim organima, međunarodnim i domaćim institucijama i udruženjima;
• obavljanje revizije vezane za sistem upravljanja IPA programima i projektima;
• pripremanje izveštaja u vezi rada Odseka;
• kontrolisanje primene propisa u oblasti finansijsko-materijalnog poslovanja u postupku prethodne kontrole;
• kontrolisanje u postupku naknadne kontrole namenskog korišćenja sredstava budžeta;
• priprema dokumentacije i sarađivanje sa rukovodiocima organizacione jedinice kod koje se vrši revizija;
• izrada izveštaja o sprovedenoj reviziji;
• izrada uputstava, priručnika i planiranje pregleda;
• sastavljanje periodičnih i godišnjih izveštaja;
• procena rizika i priprema programa revizije;
• određivanje veličine uzorka i metoda odabira uzoraka;
• obrada i dokumentovanje revizorskih nalaza i preporuka i praćenje sprovođenja preporuka navedenih u izveštajima iz prethodno obavljenih revizija.